Getragen wird das Chinderhuus Spatzenäscht seit Beginn vom gemeinnützigen sowie politisch und konfessionell neutralen Verein mit dem Namen Chinderhuus Spatzenäscht. Sein Zweck ist die Betreuung und der Betrieb einer familienergänzenden Institution für Kinder ab drei Monaten.

Der Vorstand des Vereins, bestehend aus sieben bis neun ehrenamtlich tätigen Vereinsmitgliedern, hat als Organ die strategische Leitung des Chinderhuus Spatzenäscht inne. Die operative Führung des Betriebs wird von der Hausleitung wahrgenommen.